CN氰基色譜柱的鍵合官能團氨丙基要比C18,C8柱的鍵合官能團C18,C8容易水解，所以首先要做好其使用壽命稍遜的心理準(zhǔn)備，特別是當(dāng)你的使用條件是反相條件下時。
反相條件使用時，要特別注意控制PH值范圍，PH值越低越有發(fā)生水解的危險，流動相中水的比例越高當(dāng)然也越有發(fā)生水解的危險。所以，在使用后以及準(zhǔn)備長時間放置時，必要的清洗和將氨基柱保存于純的有機溶劑中是必需的。
當(dāng)使用CN氰基色譜柱進(jìn)行酸性物質(zhì)如果汁中糖份的分析時，酸性物質(zhì)的存在意味著質(zhì)子的存在，可能會使略帶負(fù)電荷的氨基官能團質(zhì)子化，使用一段時間后對于某類的分析物保留性質(zhì)有所改變或表現(xiàn)為柱效下降。這時，專家所給的建議是：用5-10倍的柱體積的含0.5-1.0％NH3的50-50乙腈-水溶液沖洗該柱（沖洗后當(dāng)然要再用不含堿的流動相洗去多余氨），之后再進(jìn)行分析這類酸性分析物時建議在流動相中略微添加少許氨如0.1％。
CN氰基色譜柱的清洗
簡單說起來，正相條件下使用的氨基柱參照硅膠柱的清洗方法；反相條件下使用的CN氰基色譜柱參照C18的清洗方法。
（1）平時在正相條件下使用：
首先用50倍柱體積的異丙醇清洗，因異丙醇粘度較大需適當(dāng)放低流速；之后，用50倍的甲醇清洗；之后，用異丙醇過渡回到平常使用的正相流動相，即可。
（2）平時在反相條件下使用：
緩沖鹽應(yīng)及時沖洗，不能直接用純甲醇沖洗緩沖鹽等，屬常識就不作特別交待。
用50倍純甲醇沖洗；之后，用異丙醇過渡后，用二氯甲烷沖洗色譜柱；之后，再用異丙醇過渡回來到甲醇條件下。
這些清洗方法，主要是針對當(dāng)樣品中有雜質(zhì)逐步吸附累積到填料上時的處理方法，色譜柱表現(xiàn)行為為諸如柱壓增高柱效降低等。
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